Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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ptchd1Q14B62 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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ptchd1Q14B62 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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ptchd1Q14B62 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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