Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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Hoxd1Q01822 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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