Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms