Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm23924-201ENSMUST00000082474 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rps29P62274 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rps29P62274 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rps29P62274 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Rps29P62274 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rps29P62274 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rps29P62274 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rps29P62274 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rps29P62274 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rps29P62274 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Rps29P62274 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.9 ms