Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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