Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Hoxc11P31313 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Hoxc11P31313 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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