Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Gm340F6RGI3 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms