Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 D3Ertd254e-201ENSMUST00000165956 6503 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.9 ms