Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CtcflA2APF3 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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