Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Prdm16A2A935 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Prdm16A2A935 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms