Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Col4a3Q9QZS0 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Col4a3Q9QZS0 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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