Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm43829-201ENSMUST00000196191 3802 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Limd1Q9QXD8 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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