Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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