Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Zbed3Q9D0L1 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Zbed3Q9D0L1 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms