Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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