Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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Atg4aQ8C9S8 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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Atg4aQ8C9S8 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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Atg4aQ8C9S8 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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Atg4aQ8C9S8 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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Atg4aQ8C9S8 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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Atg4aQ8C9S8 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Atg4aQ8C9S8 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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Atg4aQ8C9S8 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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