Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Gm20809Q62458 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm20809Q62458 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms