Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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