Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms