Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms