Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms