Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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