Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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ptchd1Q14B62 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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ptchd1Q14B62 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
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ptchd1Q14B62 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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ptchd1Q14B62 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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ptchd1Q14B62 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
ptchd1Q14B62 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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