Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
PtprmP28828 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PtprmP28828 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PtprmP28828 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PtprmP28828 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PtprmP28828 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PtprmP28828 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PtprmP28828 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PtprmP28828 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PtprmP28828 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PtprmP28828 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PtprmP28828 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PtprmP28828 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PtprmP28828 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PtprmP28828 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprmP28828 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprmP28828 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprmP28828 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprmP28828 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms