Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PdgfraP26618 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PdgfraP26618 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PdgfraP26618 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms