Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Eb1P04230 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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