Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DffaO54786 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
DffaO54786 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DffaO54786 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DffaO54786 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DffaO54786 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DffaO54786 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
DffaO54786 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DffaO54786 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DffaO54786 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DffaO54786 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DffaO54786 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DffaO54786 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DffaO54786 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DffaO54786 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DffaO54786 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
DffaO54786 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DffaO54786 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
DffaO54786 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
DffaO54786 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
DffaO54786 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DffaO54786 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.28□□□□□ -2.21
DffaO54786 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
DffaO54786 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms