Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ArxO35085 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ArxO35085 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ArxO35085 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ArxO35085 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ArxO35085 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ArxO35085 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ArxO35085 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ArxO35085 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ArxO35085 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ArxO35085 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ArxO35085 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms