Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
AK157302I3ITR1 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
AK157302I3ITR1 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms