Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Spocd1B1ASB6 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135 ms