Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Cln8Q9QUK3 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms