Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 AC162934.1-201ENSMUST00000222880 309 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Rabgef1Q9JM13 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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