Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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Ccdc39Q9D5Y1 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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Ccdc39Q9D5Y1 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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