Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Ccdc47Q9D024 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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