Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Sgo1Q9CXH7 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sgo1Q9CXH7 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms