Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
NubplQ9CWD8 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
NubplQ9CWD8 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
NubplQ9CWD8 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NubplQ9CWD8 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NubplQ9CWD8 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NubplQ9CWD8 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NubplQ9CWD8 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NubplQ9CWD8 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NubplQ9CWD8 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NubplQ9CWD8 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NubplQ9CWD8 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NubplQ9CWD8 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms