Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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