Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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Ccdc88cQ6VGS5 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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Ccdc88cQ6VGS5 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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