Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm24296-201ENSMUST00000158297 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NipblQ6KCD5 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.33
NipblQ6KCD5 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NipblQ6KCD5 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
NipblQ6KCD5 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NipblQ6KCD5 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NipblQ6KCD5 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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