Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.57□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Pkp4Q68FH0 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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Pkp4Q68FH0 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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Pkp4Q68FH0 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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Pkp4Q68FH0 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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Pkp4Q68FH0 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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Pkp4Q68FH0 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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Pkp4Q68FH0 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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Pkp4Q68FH0 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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Pkp4Q68FH0 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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Pkp4Q68FH0 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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Pkp4Q68FH0 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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Pkp4Q68FH0 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pkp4Q68FH0 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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