Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ecm2Q5FW85 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ecm2Q5FW85 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms