Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Q3U6N9 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Q3U6N9 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Q3U6N9 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms