Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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