Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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ptchd1Q14B62 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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ptchd1Q14B62 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ptchd1Q14B62 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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