Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Pkp1P97350 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Pkp1P97350 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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