Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms