Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm22295-201ENSMUST00000083311 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm25127-201ENSMUST00000083336 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm25583-201ENSMUST00000083413 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm25577-201ENSMUST00000083414 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm24414-201ENSMUST00000083434 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm24861-201ENSMUST00000083459 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm24803-201ENSMUST00000083693 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm22580-201ENSMUST00000083727 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm24260-201ENSMUST00000083741 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm22682-201ENSMUST00000083854 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm25869-201ENSMUST00000083855 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Smim18J3QNP2 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms