Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm340F6RGI3 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms