Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Spocd1B1ASB6 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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