Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CtcflA2APF3 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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